《幻想学园》这个故事发生在一千年以前。
以南风翔、千浩羽、蓝炎南、风翼、欧亚冰五人为首的翼世界魔法学徒,分别来自神秘的天使之都、樱花阁、炎谷、风之塔、冰城,并且他们每个人都有属于各自的魔法特技和飞行羽翼,而他们每个人的羽翼都是不同颜色的,他们的世界原本是平静如水的,然,若干年后,翼世界五大势力的领地纷纷被来自恶魔之渊的鬼族、死士族、百兽族三大种族侵占,就单单是那一战,就足以让天地变色,地动山摇.战后,翼世界的学徒们败北,坠落时空结界,从此翼世界一蹶不振,大量的学徒从此流离失所,过着非人的流浪生活……背负了翼世界最后希望而选择坠落时空的五人,开始了全新的魔法历程……