2107年，人类发现了超越所有文化的化石遗迹，并以极度成熟的克隆技术完美地克隆出了被人类称为“神魔”的存在。
高傲的“神魔”们不愿向人类低下自己高贵的头颅，献出自己至高的忠诚，自2121年起至2130年为期9年的独立战争——“诸神浩劫”拉开序幕，并以人类的强行破坏“诸神的中枢”勉强胜利告终，同年，海域之中出现了人类的宿敌——希利特。
为了人类的未来，2132年科学家们再次启动“神魔”，但又为了防止“神魔”叛变，于是所谓的“蜂后计划”正式亮相！