著名海盗船“飞龙号”沉寂多年后重现江湖，劫掠了波斯向大明进贡的使船，使得怠政十余年的万历皇帝大为恼火，下令不懂水战的吴士奇率久未操练的大明水师出海捉拿海盗头子杜飞，铲平海盗聚居之地恶魔岛。吴士奇得到一位自称杜七的人帮助，出海作战，然而大海远不如他想象的那么简单，幽灵，恶魔等等从未见过的怪物纷纷出现，更有荷兰葡萄牙西班牙海盗与之为敌，更想不到的是，自己也被杜飞利用，吴士奇自身的身世也充满了迷。
另一方面，吴士奇的未婚妻慕容烟偷了水师的船，出海寻找吴士奇。
四海之王，四海之神，幽灵，恶魔，官府与海盗，在整个海域掀起滔天大浪。。。。。。