台湾联合号海钓船被日本巡逻舰撞沉后，船上16人获救，其中15人已被接回台湾，但船长何鸿义仍被扣留，岛内为此群情激愤。
6月12日，不少民众包围了日本交流协会，要求赔偿道歉，立委也呼吁新当局硬起来，准备好导弹和军舰到钓鱼岛护渔。
12日，台湾《联合报》的一则报道在岛内引起轩然大波。
该报道称，在彭佳屿北方海域执行护渔任务的和星舰接到联合号海钓船报案后，迅速于10日上午7时多抵达距离钓鱼岛9海里处海域搜集证据，与日本巡逻舰对峙一个多小时。
这是台湾舰艇多年来首度进入钓鱼岛12海里（日本宣称的领海范围）以内海域。
其间和星舰两度试图往钓鱼岛海域再深入，但均遭日舰技巧性阻拦。
就在僵持不下之际，当天上午9时海巡署接到外交部的电话，称此事要通过外交途径交涉，不要挑起外交争议。
正是这一通关键电话，导致和星舰无奈撤离。
消息披露后，民众纷纷批评当局软弱。
12日，一些渔民包围外交部抗议，并在大门外用黑漆将日本国旗上的太阳图案抹黑。
台北县长周锡玮也率众前往日本交流协会抗议，要求日本在一天之内放人，并尽快赔偿、道歉。
他说，他将向立法院长王金平和行政院长刘兆玄等人提出要求，立刻派军舰到钓鱼岛宣示主权。
民进党则把矛头指向马英九和外交部长欧鸿炼。
党团干事长赖清德称，马英九过去高举保钓大旗，但上台之后却变成了宅男。
民进党立委李俊毅要求追究到底是谁下令召回和星舰，并要求欧鸿炼为此下台负责。
国民党立委也呼吁当局适时展现强硬立场。
立委帅化民认为，目前两岸正值复谈之际，日方行动并不单纯，含有试探马英九当局外交底线的意味，处理外交争议可软可硬，如果我是国防部长，就把那里作为空军炸射的靶区。
立委林郁方说，国防部此时应该硬起来，最好下周就把军舰、飞弹准备好，大家一起去宣示主权！
新当局也和日本展开交涉。
外交部长欧鸿炼12日上午召见日本交流协会台北事务所所长池田维。
他强调钓鱼台是中华民国的领土（台湾把钓鱼岛称为钓鱼台），希望日方尽快完成事故调查，弄清责任，让船长回台。
下午，外交部官员又针对撤回和星舰一事公开道歉，承认误判形势。
总统府还发表措辞强烈的声明：钓鱼台列屿是中华民国领土，地理上是台湾的附属岛屿。
我们坚持维护钓鱼台主权的决心从未改变，也绝不改变。
同时，要求日本政府放人、道歉。
一些岛内人士评论称，这次渔业纠纷，民进党闹得很起劲，似乎很为台湾民众的利益着想。
但实际上，他们在当政时并不支持武力护渔。
据了解，2005年5月因为苏澳渔民遭日本驱赶，台日渔业纠纷闹得很大。
在各界的压力下，民进党勉强同意武力护渔，但同时鼓吹国防部应正视中共洲际导弹试射成功的意义，不要敌友不分忽略保台的真正责任。
**还要求军方低调，不要派太多将领随行护渔。
当年6月21日，当时的国防部长李杰陪同立法院长王金平搭乘凤阳号军舰，抵达钓鱼岛附近海域，高喊了几声钓鱼台是我们的等口号，随后返航。
不少岛内媒体认为，那次护渔基本是在走过场。
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