海外交易费用较多，合格境内机构投资者（QDII）多项费率普遍高于标准股票型基金，可即使如此，一些基金公司的QDII业务仍呈现亏损。
根据天相投顾数据，目前43只QDII中，除去指数型和债券型的10只产品，其余33只股票型QDII的管理费率一般是1.8%或1.85%，托管费率是0.3%或0.35%，认购费率是1.2%或1.5%，申购费率一般是1.6%。除了赎回费率相同外，QDII的管理费和托管费明显高于标准股票型基金1.5%和0.25%的平均水平，认购费也高于标准股票型基金1.0%至1.2%的平均水平。
尽管收取的管理费用高昂，基金业内的共识仍是QDII难赚钱。“管理海外的资产复杂、程序严格，耗费的人力成本也高，所以管理费和托管费都比国内高。”上海一家基金公司国际业务部人士说，以托管费为例，虽然国内银行早已经可以托管海外资产，但托管费用不菲，因为海外资产的估值计算更复杂。例如在银行托管部，估值计算1只QDII的工作量是国内普通基金的3倍。
“做QDII需要外汇额度，换汇也增加了成本。”有业内人士解释，虽然投资人是以人民币购买，但QDII产品募集成立后以外币投资于境外市场，也就是说，QDII投资前需进行购汇，在持有人赎回或分红时，需进行结汇，由此产生的成本都需要从固定费率中支出。
QDII在人力、投研和系统方面的花费可谓不菲。QDII需要熟悉成熟国家资本市场的人才，肯定需要高薪挖角；海外调研、海外股票分析系统、产品后台系统的建立同样投入巨大。据了解，由于外方投顾一般要从管理费中分走20%至30%，为了降低成本，一些QDII已经弃用外方投顾。
“最关键的是，基金公司旗下一般只有一两只QDII、且普遍规模较小，所以很难赚钱。”深圳一家中型基金公司国际业务部人士称，就算各项费率普遍高于标准股票型基金，QDII现在的募集规模太小，提取管理费收入除去成本一般都是亏本的。“除了第一批出海的QDII外，一般第一只QDII很难给公司挣钱，因为前期一次性投入太多，如果多发几只，规模上去了才有可能产生边际收益。”
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